一、合同備案基本程序：
經(jīng)貿(mào)部門審批
--> 向海關(guān)服務(wù)中心購買空白《登記手冊(cè)》
--> 合同預(yù)錄入
--> 海關(guān)審核后開具《開設(shè)保證金臺(tái)帳聯(lián)系單》
--> 向中國銀行申請(qǐng)?jiān)O(shè)立臺(tái)帳 ---> 海關(guān)核注銀行簽發(fā)的《臺(tái)帳登記通知單》
--> 海關(guān)進(jìn)行計(jì)算機(jī)異地傳輸 ---> 收到傳輸成功回執(zhí)后核發(fā)《登記手冊(cè)》。
二、合同備案所需單證：
1、經(jīng)營(yíng)單位申請(qǐng)報(bào)告。
2、外經(jīng)貿(mào)主管部門《批準(zhǔn)證》，屬于進(jìn)料加工的需要加蓋稅務(wù)部門印章。
3、對(duì)外簽訂的進(jìn)出口合同。
4、經(jīng)營(yíng)單位基本帳戶開立證明。 來源:報(bào)關(guān)員培訓(xùn)網(wǎng)
5、加工企業(yè)所在地經(jīng)貿(mào)部門出具的《加工生產(chǎn)能力證明》。
6、委托加工應(yīng)提供經(jīng)營(yíng)單位與加工企業(yè)簽定的符合《中華人民共和國合同法》的委托加工合同（協(xié)議）。
7、開展異地加工貿(mào)易，須提供經(jīng)營(yíng)單位所在地海關(guān)出具的關(guān)封，內(nèi)含《異地加工申請(qǐng)表》一式二份。
8、首次開展加工貿(mào)易須提供經(jīng)營(yíng)單位和加工企業(yè)的《營(yíng)業(yè)執(zhí)照》、《稅務(wù)登記證》復(fù)印件及《海關(guān)登記通知書》。
9、經(jīng)營(yíng)單位的介紹信或委托書。
10、加工工藝說明。
11、如需異地口岸進(jìn)出口報(bào)關(guān)，須填寫《異地報(bào)關(guān)申請(qǐng)表》。
12、海關(guān)需要的其他資料。
注：1）海關(guān)對(duì)首次開展加工貿(mào)易的企業(yè)實(shí)行驗(yàn)廠制度；對(duì)單證齊全、驗(yàn)廠合格的企業(yè)，海關(guān)在3個(gè)工作日內(nèi)核發(fā)《登記手冊(cè)》。
2）辦理加工貿(mào)易合同備案的企業(yè)屬AA類的，免設(shè)臺(tái)帳；屬A類企業(yè)的，需設(shè)臺(tái)帳，實(shí)行“空轉(zhuǎn)”；屬B類企業(yè)的，需設(shè)臺(tái)帳，一般商品實(shí)行“空轉(zhuǎn)”，限制類商品實(shí)行“實(shí)轉(zhuǎn)”；屬C類企業(yè)的，需設(shè)臺(tái)帳，一律實(shí)行“實(shí)轉(zhuǎn)”；D類企業(yè)不得開展加工貿(mào)易業(yè)務(wù)。經(jīng)營(yíng)單位與加工企業(yè)非同一分類的，海關(guān)按就低不就高的原則管理。對(duì)外商提供的進(jìn)口輔料品種在規(guī)定范圍內(nèi)，且金額在5000美金以下的，免辦手冊(cè)，不納入臺(tái)帳管理。
三、辦理5000美元以下78種客供輔料備案手續(xù)所需單證：
1、申請(qǐng)報(bào)告。
2、進(jìn)口發(fā)票、裝箱單（一式二份）。
3、出口合同（一式二份）。
4、經(jīng)營(yíng)單位介紹信或委托書。
四、合同核銷
（一）基本流程：
合同執(zhí)行完畢后一個(gè)月內(nèi)企業(yè)向海關(guān)申請(qǐng)核銷
--> 預(yù)錄入
--> 海關(guān)審核
--> 簽發(fā)《臺(tái)帳核銷聯(lián)系單》
--> 中國銀行銷帳
--> 海關(guān)核銷結(jié)案
--> 打印結(jié)案通知書。
注：企業(yè)必須在海關(guān)規(guī)定的期限內(nèi)向海關(guān)辦理核銷手續(xù)。對(duì)無正當(dāng)理由未向海關(guān)辦理核銷手續(xù)的，海關(guān)根據(jù)有關(guān)規(guī)定進(jìn)行處罰。
（二）所需單證
1、經(jīng)營(yíng)單位申請(qǐng)核銷報(bào)告。
2、進(jìn)出口報(bào)關(guān)單。
3、《登記手冊(cè)》。
4、海關(guān)需要的其他單證，如核算表、劃料圖等反映實(shí)際加工情況的資料。